在“公司+農戶”的合作模式下： - 發票開具： - 青飼料部分：青飼料屬于農業初級產品，免增值稅。如果公司從稅務局領取有農副產品收購發票，可以自行開具；如果沒有，可以在稅務局代開免稅的普通發票。 - 農戶養殖勞務部分：目前稅法上沒有對勞務單獨免增值稅的規定，只是對自產農產品銷售免增值稅，因此理論上農戶提供養殖勞務屬于增值稅應稅范圍。根據國家稅務局總局公告2018年第28號規定，個人零星交易低于500元/次的可以不需要發票，高于500元/次的則需要發票。所以公司可以將支付給農戶的報酬適當分開，每次金額控制在500元以內，這樣就可以不需要農戶開具發票。 - 增值稅：根據《國家稅務總局關于納稅人采取“公司+農戶”經營模式銷售畜禽有關增值稅問題的公告》（國家稅務總局公告2013年第8號），采取“公司+農戶”經營模式從事畜禽飼養，納稅人回收再銷售畜禽，屬于農業生產者銷售自產農產品，免征增值稅。但這里的畜禽應當是列入《財政部國家稅務總局關于印發〈農業產品征稅范圍注釋〉的通知》（財稅字〔1995〕52號）文件中規定的農業產品，且“農戶”僅指農民個人，不包括從事農業生產的單位。 - 個人所得稅：根據財政部、國家稅務總局關于農村稅費改革試點地區有關個人所得稅問題的通知（財稅(2004)30號），對個人或個體戶從事種植業、養殖業、飼養業、捕撈業，且經營項目屬于農業稅、牧業稅征稅范圍的，其取得的“四業”所得暫不征收個人所得稅。