你公司購買該種植專業合作社的糧食，取得的增值稅專用發票通常是可以抵扣的。 對于一般納稅人來說，購進貨物或服務取得增值稅專用發票，按規定可抵扣的進項稅額，在申報時填寫在《增值稅納稅申報表附列資料（二）》“（一）認證相符的增值稅專用發票”對應欄次中。 該合作社不能跨省開具農產品收購發票給你公司。農產品收購發票的使用有一定的地域限制，通常只能在本地區（如本省、自治區、直轄市內，或所在縣、市、區范圍內）開具。 雖然可以跨市或跨省收購稻谷等農產品，但如果需要開具收購發票，應遵循相關規定。例如，有的地方規定到本市以外收購農產品的，可向銷售方索取普通發票，或者向主管國稅機關申請開具《外出經營活動稅收管理證明》后，向收購地國稅機關申請領用收購發票。具體規定可能因地區而異。