在自然人電子稅務局扣繳端填報時，基本養老保險應該填寫個人部分，而不是單位加個人的總和。基本養老保險在個稅申報中，填寫的金額是指個人自己繳納的部分，而不涉及單位繳納的部分。單位繳納的部分一般由單位直接繳納到社保部門，與個人所得稅申報無直接關聯。因此，在填寫個人所得稅申報表時，只需要填寫個人實際繳納的基本養老保險金額即可。