主要留存備查資料： ①自主、委托、合作研究開發項目計劃書和企業有權部門關于自主、委托、合作研究開發項目立項的決議文件； ②自主、委托、合作研究開發專門機構或項目組的編制情況和研發人員名單； ③經科技行政主管部門登記的委托、合作研究開發項目的合同； ④從事研發活動的人員（包括外聘人員）和用于研發活動的儀器、設備、無形資產的費用分配說明（包括工作使用情況記錄及費用分配計算證據材料）； ⑤集中研發項目研發費決算表、集中研發項目費用分攤明細情況表和實際分享收益比例等資料； ⑥“研發支出”輔助賬及匯總表； ⑦企業如果已取得地市級（含）以上科技行政主管部門出具的鑒定意見，應作為資料留存備查。