老師是不是意思就是不勾選的進項稅還是記在借方，借：應交稅費，應交增值稅-待認證進項稅？

是的，你的理解是對的。

那等到下個月抵扣進項稅，怎么記？

借：應交增值稅-進項 貸：應交增值稅-待認證進項稅

你好那稅務局報稅怎么弄？有了留底稅

正常填寫報稅，留抵不影響正常的申報。