付款申請單指的是當一筆費用需要付款時,由請求支付的人準備的表格。申請單里記載付款的相關信息,包括收款人、支付金額以及支付原因等。而付款單則是付款單位按照申請單中所記錄的信息準備的確認付款的文件,其中包括付款時間、付款金額、付款方式等。