殘疾人就業保障金繳費申報表填的上年在職人工工資總額應該填寫的是實發工資總額，而不是計提工資總額。實發工資總額是上年度用人單位實際支付給職工的工資，包括基本工資、獎金、津貼、補貼等所有工資性收入。計提工資總額則是根據一定的會計規則，對員工應該得到的工資進行核算，記錄在賬目中的金額。 在實際操作中，實發工資總額是實際發放到職工手中的工資，而計提工資總額則是根據相關的會計制度進行核算后，計入用人單位的工資總額中。因此，在填寫殘疾人就業保障金繳費申報表時，應該按照實際發放的工資總額進行填寫，即實發工資總額。