根據(jù)《中華人民共和國審計法》和《中華人民共和國審計法實施條例》的規(guī)定，工程子項目的結(jié)算審計和整體工程的財務竣工決算都是審計機關(guān)對建設項目的監(jiān)督和審查，兩者有一定的先后順序。 一般來說，工程子項目的結(jié)算審計應當在工程子項目完工并通過驗收后進行。結(jié)算審計是對工程子項目的實際完成情況和費用支出進行審查和核實，以確保工程子項目的建設符合規(guī)劃要求，且資金使用合理、合法。在結(jié)算審計完成后，才能進行整體工程的財務竣工決算。 整體工程的財務竣工決算是在所有工程子項目都完成并通過驗收后，對整個建設項目的投資效益、資金使用情況、建設成本等方面進行全面、系統(tǒng)的分析和總結(jié)。在財務竣工決算完成后，才能最終確定建設項目的投資效益和財務狀況。 因此，事業(yè)單位支付基建工程子項目尾款的時間應當根據(jù)具體情況而定，一般在結(jié)算審計完成后進行。如果未經(jīng)過結(jié)算審計或財務竣工決算，事業(yè)單位應當暫停支付尾款，以避免資金使用不當或出現(xiàn)其他問題。