如果海關繳款書是雙抬頭報關會不會影響退稅？

你好，這個不影響的應該是實際的付款人、貨物的持有人來退稅。

雙抬頭報關，海關繳款書的稅金是A公司自己付，但是貨款是通過報關公司支付，因為報關單上的“境內收貨人”是報關公司，所以要通過報關公司付匯，報關單的“消費使用單位”是A公司。

這樣的雙抬頭報關可以申請退稅嗎？

你好，那就是a公司抵扣退稅

貨款不是A公司自己直接付匯的也申請退稅嗎？

是的，是的，可以的。你們得有代理協議。