外經證預繳增值稅稅款憑證的做法如下： 1、在增值稅稅款應繳專戶中，將申請預繳的稅款存入該賬戶； 2、在企業財務系統內，進行登記，由會計人員填寫外經證預繳增值稅稅款憑證； 3、憑證中應當核對稅款金額、增值稅稅率、外經證號碼等信息； 4、核對無誤后，由會計人員按照會計準則審核和記賬，并在企業財務系統中留存憑證； 5、將外經證預繳增值稅稅款憑證和稅款發票一起交至稅務機關，由稅務機關審核確認后，進行稅款確認； 6、稅款確認后，稅務機關會將稅款分別轉入企業增值稅進項稅額轉出賬戶和銀行賬戶，將稅款繳納完成。