增值稅扣稅憑證主要有： 1、增值稅專用發票：此類憑證又稱“三聯單”，包括購貨方聯、銷貨方聯和稅務機關聯，是增值稅付款的有效證明。 2、其他增值稅稅收憑證：包括收購發票、收購收據、收購單據、收購函件等。 3、增值稅普通發票：此類發票是增值稅納稅人開具的有效憑證，可以作為稅務機關核實用，但不可作為抵扣稅款的憑證。 4、增值稅抵扣原始憑證：如進口稅收繳款書、運輸工具載貨清單等，可以作為納稅人申請抵扣增值稅的有效憑證。 5、其他增值稅憑證：包括征收憑證、定額發票、代扣代繳憑證、稅務機關憑證等。