零申報企業所得稅年報資產總額的填寫原則是：按照實際情況填報，一般是按照企業實際資產總額減除累計折舊后的資產總額填報。例如：企業實際資產總額100000元，其中有累計折舊額20000元，那么零申報企業所得稅年報資產總額應填報為80000元。若有負值的情況，負值的部分統一填報為0。