工程進度款的稅率取決于具體情況，根據《中華人民共和國財政部關于附加稅稅率調整的通知》（財稅〔2009〕77號）的規定，建筑安裝業的增值稅稅率為17%，建筑工程施工企業的消費稅稅率為3%，建筑工程施工企業的出口免稅率自動申報為0%。同時，如果工程進度款對應的工程累計收入超過100萬元，工程施工企業應該繳納印花稅。