負數發票是不允許在增值稅申報中使用的，如果有負數發票，則必須對去年的正數發票進行補正，將負數發票拆分到去年的正數發票上，這樣就可以將負數發票轉換為正數發票，并列入增值稅申報。但請注意，做這件事的時候必須事先與稅務機關共同核定，以確保申報準確性。而且，拆分后的正數發票，當季度報稅時，如果實際繳納金額小于正常繳納金額，則需要補繳，或者拆分后的正數發票過去錯過稅款，繳納金額小于正常，則可以申請部分退稅。