應該及時向發票開具單位要求補開1%增值稅發票，再把補開的1%增值稅發票加入到增值稅申報系統中，進行統一管理，若發票開具單位未能提供補開1%增值稅發票，企業需要根據增值稅法規定，在自行計算增值稅后，將多收的2%增值稅繳納至工商稅務機關指定的銀行賬戶，并保存相關憑證作為稅務證明。