根據《中華人民共和國稅收法》的規定，凡是在中國境內印花稅法定的合同書和單據，應當支付印花稅。因此，微信托管運營合同需要交納印花稅。目前，國家規定，普通的合同的印花稅按照合同金額的0.05%收取，在微信托管運營合同上，也需要按照這個比例來進行支付印花稅。另外，在附加合同上，如果有特殊條款，還需要按照國家規定的比例進行支付。