企業應該主動和稅局進行溝通，說明情況，并能提供有效的處理方案。具體處理流程如下： 一、企業應該如實申報發生的進項轉出情況； 二、提交有關材料，以便與稅局核實發生的實際情況； 三、出具納稅調減意見書； 四、更正原有納稅申報； 五、按照稅局要求辦理稅款繳款； 六、保留相關單據作為備查，以便處理出現的稅務糾紛。