是的，現在小規模開3%的普票需要繳納增值稅。比如，假設一家公司在2017年1月1日銷售的商品總額為10000元，其中1%的普通發票金額為600元，則根據稅務部門的要求，該公司需要繳納增值稅180元(600*3%)。另外，增值稅計算公式：增值稅金額=開具發票金額×稅率，其中，稅率是按照小規模納稅人的最低3%計算。