是的。根據《中華人民共和國增值稅暫行條例》第二十三條規定，納稅人應當在同一稅收管理地的使用的貨物取得進項稅額時，按照以下規定扣減預繳稅額：（一）異地購進的貨物應當減去在異地預繳稅款；（二）本地購進的貨物應當減去在本地預繳稅款；（三）異地與本地購進的貨物應當減去異地和本地預繳稅款。由此可見，當納稅人在本地電子申報增值稅的情況下，應當減去在異地預繳的稅款，以減少稅收負擔。