老板想要從賬戶中取出50萬元現金，首先應根據資金來源和用途，即采取相應的合法措施以證明款項的合規性。一般來說，現金收入需要繳納個人所得稅，但由于沒有發票沖進來，所以需要老板自行計算應納稅額，及時報稅，以便避免個人所得稅的滯納金。另外，如果存在收支之間的不一致性，還需要考慮企業所得稅。拓展知識：企業所得稅是指企業在從事經營活動中產生的收入，根據《企業所得稅法》應當納稅的費用，由財政部門按照有關稅收管理規定征收的征稅。