是的，如果企業有研發部門，它們仍然可以在做賬的時候對研發支出進行抵押。根據《企業所得稅法》的規定，企業的研發費用可以作為“允許抵扣的企業所得稅費用”進行抵押，以減少企業應納稅額。研發費用包括研發費用、專利費、商標費等，它們可以按照不同比例減免企業應納稅額，最高減免額不超過企業當期應納稅款額的35%。 此外，根據相關法律法規中對研發費用的有關規定，一定程度上，企業可以根據實際情況支出某些指定的研發費用，并申請減免企業所得稅。例如，研發機構開展的基礎研究，也可以拿到減免政策的支持，國家還有相關的國家稅收優惠政策可以支持這些企業的發展。 綜上所述，對于有研發部門的企業來說，在做賬的時候可以做研發費用的抵押，以減少企業應納稅額，可以從一定程度上節約企業的財力，拓展企業的發展機會。因此，把握相應的優惠政策，及時申報研發費用，以減少企業應納稅額，是企業發展的有效措施。