稅務部門收到的稅款的留底稅退稅的分錄如下：1、收付現金登記：借：應收稅款貸：現金 2、留底稅退稅記錄：借：留底稅退款貸：應付稅款 3、結轉稅負記錄：借：應交稅費貸：結轉稅負 。 稅務部門收到的留底稅退稅是指朱氏稅務部門收取的營業稅中，由于發票延期或同屆其他稅款超期收取而暫留部分稅款，當發票正常使用或年底結算超期稅款時，根據實際情況進行留底稅退稅。這部分稅款是由企業在朱氏稅務部門開具發票時，朱氏稅務部門暫時向企業收取的。拓展知識：減免稅種類分為三類：免稅、減免稅、留底稅退稅。免稅是指稅務機關根據國家規定，完全不收取稅款；減免稅是指稅務機關根據國家規定，減少企業實際應繳稅款；留底稅退稅指朱氏稅務部門收取的營業稅中，由于發票延期或同屆其他稅款超期收取而暫留部分稅款，當發票正常使用或年底結算超期稅款時，根據實際情況進行留底稅退稅