員工報銷的住院費用做賬的流程主要包括：1、登記報銷：企業收集員工關于住院報銷的相關資料，并進行登記，以便后面的審核和財務報銷。2、審核核實：企業根據住院報銷提出的資料，對住院的真實性，報銷金額的準確性進行審核。3、編制憑證：憑登記和審核通過的資料，編制現金支出憑證，登記好憑證號，準備進行財務報銷。4、財務報銷：將審核通過的住院報銷費用進行付款，付款時，財務需要核對憑證號來付款，付款完成后登記冊上登記住院報銷信息，并和憑證號進行關聯，以便后續查詢和檢查住院報銷信息。 拓展知識：現在，大多數企業已經把住院費用報銷事宜數字化，采用ERP財務系統管理，可以有效的實現住院費用的報銷，并且實現了數據的審核、流轉、存儲等，能夠大大的減少重復工作和人工錄入等，提高效率，從而達到財務的改善和費用的有效控制。