納稅滯留發票處理一般需要按照規定的期限及稅款種類處理，一般來說，首先應該核實發票，確認發票上的稅款信息是否完整、填寫是否正確、蓋章是否有效等；其次，核實發票是否被他人使用過，發票是否已經在納稅系統中認證過；最后，審核發票，確認發票上的納稅信息是否完整無誤，如果滿足條件，可以把發票放到稅務系統中進行認證，完成所有稅款的抵扣。 此外，納稅人還要注意，應當及時將滯留發票上傳至納稅系統中，以便及時完成納稅登記，避免因稅款認證不及時或未認證而導致罰款。同時，當納稅人對發票有異議時，也可以根據規定申請重開發票或者作出其他補償等處理措施。