在這種情況下，無論以何種方式付款，您都應當將開具的增值稅專用發票紅沖，再重新開具給客戶，否則可能會影響客戶對財務部分的核實。要發票相應的紅沖，您可以憑借指定的紅字發票，也可以在開具的新專用發票上標明“紅沖”的字樣，確認無誤后，便可以向客戶提供紅沖的發票。若是要開具新的增值稅專用發票，您可以參考國家相關的規定，在新的專用發票上登記并填寫“紅字”的具體內容。 另外，為了確保您的正常經營，您在實際操作中還要注意以下幾點：首先，確保發票上的增值稅稅額與客戶實際支付的費用金額一致，避免發票出現發票金額矛盾的情況；其次，要及時向稅務機關遞交相應的紅沖發票申報及銷售統計表，并定期進行發票確認；最后，要注意妥善保存紅沖發票，以防漏銷紅字發票或利用此發票作為偷稅漏稅的依據。 總之，當您的公司的客戶只付80%的錢給公司結算時，您應當將開具的增值稅專用發票紅沖，再重新開具給客戶，以此來確保客戶對財務部分的核實，以及您的正常經營活動。