電商公司如果收到專用發票，應先在發票抬頭核對，驗證發票內容，保證發票的合理性和有效性；然后根據發票內容按照賬務處理的規定，進行分別做賬務處理，因為發票金額實際包含了員工工資和服務費，所以，公司應當把員工工資與服務費分開做賬務處理。員工工資應劃轉至工資支出科目，服務費應劃轉至應付賬款科目，以便于財務管理、統計以及內部控制。同時，還要遵守國家的稅收政策，按照發票金額實行稅費繳納。拓展知識：對賬務處理特別是發票認證，應結合企業的賬務操作流程，采用有效的管理方式，制訂賬務處理與發票認證標準，確保發票處理準確無誤。