當賬面余額與增值稅申報表的期末留底稅額不一致的時候，首先應該核實增值稅申報表的期末留底稅額是否開票正確，有無遺漏或是否重復計入，并檢查賬面余額是否經過紅字修改等情況。如果發現有誤，應及時與稅務機關進行溝通，盡快解決問題。此外，在進行稅額核算時，企業要注意相關會計政策的變更，如稅法調整、稅收政策變更、減免稅政策的施行等，積極響應政策變化，準確報送稅務登記信息，確保稅費的準確申報和繳納。