該公司在收購玉米時開具了農產品收購發票，上面注明的農產品買價為1000元，根據《中華人民共和國稅收法》第十六章的規定，購買農產品的進項稅額可以通過買方向銷方開具的發票計算，其計算方式為：存貨金額×稅率=進項稅額。因此，該公司收購玉米時所產生的進項稅額為1000元×9%=90元。 拓展知識：農產品收購發票是指向農民收購農產品，銷售方發給買方的發票，是買方確認收貨并交款以及銷售方交付發票的有效憑證。此外，農產品收購發票也是買方確認收貨以及交稅情況的重要證據。