一般在處理這種情況時，將拆分憑證金額，即把憑證金額減少0.01元，并開具一份金額為0.01元的憑證，將其作為補差價憑證。這是因為憑證金額的準確性更重要，不能容忍任何相差，所以補差價憑證的開具是必要的。 此外，當憑證金額相差0.01元的情況不斷發生時，可以考慮回溯排查系統中的問題，檢查所有與憑證金額有關的條款、計算公式等，以確保憑證金額的準確性。另外，要注意保存系統中憑證金額與實際開具發票金額的記錄，以便及時發現并處理出現的差錯。