個人所得稅自然人建檔發生異常，是指稅務機關根據稅法的規定無法建立或更新個人納稅人的稅務登記信息。發生異常的原因可能有多方面，具體包括：（1）個人主體身份信息和稅務登記信息不符。（2）個人征管數據出現缺失或錯誤。（3）稅務機關信息系統出現故障，導致無法建立或更新稅務登記信息。（4）稅收法規的更新導致建檔程序發生變化。如果發現個人所得稅自然人出現建檔異常，可通過稅務部門官網查詢相關信息，并聯系當地稅務機關，盡快解決問題。同時，個人還應提高自身防護意識，防止被非法騙稅。 拓展知識：個人所得稅是由稅收法規規定的，它是指國家對個人工資、報酬和利潤等收入征收的一種稅。一般來說，個人所得稅應由個人自行繳納，分為四類：年度預繳所得稅、按月預繳所得稅、收入轉移適用所得稅和正常所得稅等。個人應該根據當期收入情況，按規定時間和金額繳納個人所得稅，確保稅收有序申報。