A公司和B公司首先要確認長期股權投資的所屬，如果是A公司的，轉讓就要扣除其他應付款41萬，剩下59萬進行轉讓，A公司賬上應該記錄，其他應付款減少41萬，長期股權投資減少59萬；B公司賬上則記錄，長期股權投資增加59萬、股東權益增加59萬。 如果長期股權投資屬于B公司，那么A公司就不用扣除其他應付款41萬了，直接將100萬轉讓給B公司，A公司賬上應該記錄，長期股權投資減少100萬；B公司賬上則記錄，其他應收款增加41萬，長期股權投資增加100萬，股東權益增加100萬。 拓展知識：股權轉讓的定價是需要注意的問題，轉讓價格不低于賬面價值，轉讓價格過低可能會被認定為出售所得收益，則有可能被主管機關認定為虛假交易，對于受讓方而言，轉讓價格過低可能會導致受讓方被要求追加報告期內合理價值以及相應稅金；任何股權轉讓均應按照公平原則進行定價，以避免賬務分錄產生糾紛。