施工單位在工程所在地繳納增值稅時只能抵扣分包和勞務的專票，不能抵扣材料專票，原因是有關法規規定，一般就業單位只能抵扣分包和勞務，材料專票不能抵扣。施工單位需要繳納增值稅時，可以把分包和勞務的專票作為增值稅的抵扣，減少繳納增值稅的金額，但材料專票不能用來抵扣增值稅。拓展知識：施工單位在繳納增值稅時，除了可以抵扣分包和勞務的專票，還能抵扣購置固定資產、完成增值稅免抵退稅、抵扣捐贈等所得稅稅款，減免支出等。