申請留抵退稅的電子稅務局的操作流程： 1、首先，企業必須認證申請通行證，然后登錄申請留抵退稅官網。 2、在登錄網站后，根據自己的情況，選擇對應的申請步驟，并填寫各項申請材料。 3、核對申請信息后，企業需要提交稅務機關，并打印稅務相關的單證，例如，申請受理確認書、稅務承諾書和工商登記證。 4、向稅務機關提交審核后，以電子形式發放通知函，給予申請留抵退稅的最終認可。 5、打印通知函，確認退稅申請材料的真實性，攜帶資料辦理相關的稅務手續。 拓展：雖然大多數企業都可以通過電子稅務局申請留抵退稅，但有些地區可能仍然需要前往稅務所辦理，具體需根據各地稅務機關的規定而定。