企業在電子稅務局申請留抵退稅時，由于稅務局會根據納稅人所提供的材料與相關數據，進行審核并確定退稅額之算法，相關核算的系統中還存在著手續費和費率留存（存開稅額的一部分）的情況，因此最終退還的金額會稍有差異。 此外，由于稅務局制定的退稅算法是以時間為約束，而且一般會推行滾動式退稅，即當新一財年進入內，系統會優先計算新一財年的暫付與滾動退稅額，因此企業最終實際收到的退稅金額也可能會有一定的差異。 拓展知識： 在申請留抵退稅時，企業還要注意及時查詢留抵的退稅情況，以及定期更新稅務局的退稅數據，以防止實際繳納的稅額和申請的退稅額不符，從而造成稅務風險。