根據甲方確認的進度單來確定成本的話，你的收入應該是基于進度單上的不含稅金額確認的。你應該按照甲方確認的進度單進行發票開具，并把發票金額支付給你，而不是進度單上的金額。這樣，你就可以根據甲方確認的進度單來計算成本，并從發票金額中抵扣掉稅費，得到不含稅金額，再結合甲方確認的進度單來確定你的收入金額。另外，為了使你更全面地理解如何計算和確認成本，你也可以從會計知識的角度，學習下有關成本核算和成本控制的相關知識，以幫助你更加準確、更有效地掌握計算成本的方式。