按照甲方的進度單子開票收款，收入需要按照不含稅金額確認收入。比如，假設甲方向乙方支付了1000元，該單據應以不含稅金額1000元的形式確認收入。乙方根據雙方的約定，應該給予對方稅費的抵扣，把實際上收到的稅金連同其它一些額外的費用一起支出，然后再進行收款確認，這樣才能確保收款的準確性。 此外，如果甲方有把收入體現在收據上，乙方可以考慮直接確認收款，而不用把稅額扣除，這樣可以使收款過程變得更加便捷。另外，為了減少稅金的負擔，乙方也可以到地方稅務局確認，然后請稅務部門減免稅收。這樣就可以減少企業在收入確認過程中所面臨的稅收負擔，從而節省企業的經濟成本。