增值稅專票是可以全部認證抵扣，但是是以稅總額實際抵扣金額作為限制，就是說銷項發票金額總和大于進項發票金額，只能從銷項發票中抵扣到進項發票金額以及稅總額所允許的最大金額，抵扣金額不得超出稅總額，因此銷項減進項的結果有可能是負數。 此外，增值稅專票抵扣還受有效性限制，即發票必須是購買方開具且按期繳納增值稅的有效發票，才能實現抵扣，而進項稅額則是銷項稅額減去已抵扣的稅額后的余額。