在員工工資中，應當將扣款計入到“薪酬專用科目”中，該科目由薪酬總賬科目構成，主要科目包括應發工資、社會保險費、工會經費、工資獎金及津貼、補貼和職工教育經費等。將員工工資中的扣款，應當按照扣款項目的性質，分別計入每一科目，簡單計入一科也可以，但要清楚記載每一項扣款的明細情況和金額。 拓展知識：薪酬科目的構成可以由員工的薪酬構成和其他費用構成，其中的應發工資包括基本工資、津貼、加班補助、獎金等，應扣繳的社會保險費包括養老保險、失業保險、醫療保險、住房公積金等，應扣的個人所得稅，考勤扣款，違紀違章扣款等。