如果跨區域涉稅事項報告重復申請，應當及時發現并及時向稅務機關提出申請。首先，應當發現并及時做好文件歸檔工作，以便將來查詢所有報告的信息。其次，要及時向稅務機關提出申請，及時說明重復申請的情況，并提出合理的補充證明材料，以便有效避免涉稅風險。最后，及時跟蹤分析稅務機關的處理決定，如果有錯誤，及時跟蹤處理，及時采取補救措施，以避免風險和影響經濟效益。 此外，在跨區域涉稅事項申報時，為了有效避免重復申報的問題，應當建立一個統一的跨區域稅務管理平臺，該平臺可以有效的實現統一的稅務管理，以避免涉稅事項的重復申報。此外，稅務機關還可以設立稅務審核機構，以確保涉稅事項報告的審核質量，并將已經審核通過的報告存檔在統一的稅務管理平臺中，以防止重復申報。