根據財務規定，我們在開具發票和結算工程款時，必須按照實際支付的金額填寫發票，但是質保金必須分開記賬和發票。根據您的需求，首先開出一張發票，金額為20000元，其中，記賬上可以以20000-1000=19000的記賬金額進行登記，同時在質保金的備注欄里，可以填寫質保金1000元，然后再開一張發票，金額為1000元，記賬為1000元，以此記賬，即可解決您的問題。 拓展知識：質保金也叫工程保證金，是指在施工合同中，甲方將一定數量的資金存入一定的金融機構，以擔保乙方履行施工合同的一種手段。質保金一般用于擔保乙方按期完成施工，負責修理、補充、穿補及其他支付等事宜，是工程款支付的一種補充擔保措施。