一般來說，收到合作社開具的農(nóng)產(chǎn)品的普票，納稅人公司是可以抵扣增值稅的，但是需要滿足一定的條件，即確保農(nóng)產(chǎn)品貨物的進入，存在購銷合同，是可以抵扣的。特別的，在收到的農(nóng)產(chǎn)品合作社進口的普票上，不能讓允許抵扣增值稅。 同時，如果納稅人公司收到的是國內(nèi)合作社開具的農(nóng)產(chǎn)品普票，則可以抵扣增值稅。關(guān)于抵扣增值稅，納稅人公司還需要準(zhǔn)備符合要求的購銷合同，發(fā)票，農(nóng)產(chǎn)品批件及其他相關(guān)憑證，以便向稅務(wù)機關(guān)申報抵扣。 此外，納稅人公司在抵扣增值稅時，如果發(fā)現(xiàn)增值稅填寫不準(zhǔn)確，可申請財政部門補報，以免耽誤抵扣。另外，如果增值稅開票時，確有不足之處，還要及時與財政部門溝通，申請補開發(fā)票，保證抵扣權(quán)益。