小規模的民間非營利組織屬于非稅務登記的組織，根據《發票管理條例》的規定，小規模的民間非營利組織需要參加開票信息服務，才能實行發票管理，從而對其免征增值稅。此外，根據《增值稅暫行條例》，小規模納稅人可以申請免征增值稅，但其不得開具發票。因此，小規模的民間非營利組織不能開免稅發票的。但是，小規模的民間非營利組織可以向已經辦理稅務登記證的組織或者個人申請對方代開發票，以減輕自身的稅收負擔，但是經代開發票方抵扣申請方稅款納稅收入不能超出其年度累計銷售額的四倍。拓展知識：除了小規模納稅人，一般納稅人也可以申請免征增值稅，但是需要滿足一定的條件，具體為：其一，屬于享受增值稅減免政策或增值稅低稅率征收項目的納稅人；其二，累計營業收入12個月內不超過50萬元；其三，從業人員不超過20人。