網簽三方協議扣款的具體流程為： 1. 雙方簽訂三方協議，協議中應包括扣款方式、扣款金額、扣款時間等條款。 2. 三方賬戶在網銀開戶，并將協議細節正式確定。 3. 甲方將貨款轉入三方賬戶中，同時網銀系統會自動記錄貨款轉入時間，并可以隨時自行查詢貨款狀態。 4. 乙方通過網銀實時進行貨款扣款，扣款金額必須與三方協議簽訂前的約定一致，否則甲方有權回撥貨款，乙方有義務補足不足的貨款。 5. 三方支付完成，乙方需要定期向甲方及三方賬戶明確發票，以印證扣款完成。 扣款時，每一方都應當嚴格遵守三方協議，認真查閱協議各項條款，嚴謹管理賬戶，逐步完善實施程序，及時發票印證，以確保三方賬戶貨款正常性流轉。 拓展知識：三方賬戶可以進行跨行轉賬，支行相同的情況下，可以享受跨行快捷扣款，節約時間；另外，三方賬戶還可以綁定實時憑證支付，增加交易的安全性。