根據目前國家有關法規規定，當合同實際發生金額大于合同簽訂金額時，印花稅以實際發生金額為基數繳納。印花稅應當由出資實際發生金額計算收取，即實際發生金額作為計稅依據。實際發生金額指的是根據雙方對帳單明確確認的實際支付的金額，而不是按合同約定的金額結算的合同數額。印花稅的繳費比列并不影響繳費的基數，因此只要實際支付金額大于簽訂金額，都要按照實際支付金額繳納印花稅。 在繳納印花稅時，我國還制定了一定的征稅比例，根據不同的納稅主體在不同的行業，以及不同的付款方式，印花稅比例會有所不同，常用的印花稅截止比例為0.05%，但也有更高的截止比例，比如質押融資印花稅的截止比例就比較高。因此，只要實際支付的金額大于簽訂的金額，就應當按照實際支付金額來繳納印花稅，而不能按照簽訂金額算繳納印花稅。 此外，在繳納印花稅時，可以憑借統一開具的印花稅完稅證明申請稅收返還，可以通過這種方式緩解繳納印花稅時造成的負擔。