財產清查發現因管理不善造成庫存包裝物發生損毀，損毀產品數量為100件，單位成本為300元，需要承擔的增值稅為3900元。根據增值稅法，當實物流通領域發生破壞或滅失，可以通過征收增值稅來補償損失。由于損壞的產品的單價為300元，100件總價為30000元，根據增值稅法，企業在此需要承擔增值稅3900元。 拓展知識：增值稅是國家稅收的主要組成部分，是從生產經營活動中產生的價值中收取的稅款。增值稅是一種稅金，它從未加工或者低加工產品開始，隨著商品價值的不斷提高而累積，最終形成一定數量的稅款。