物流公司代收貨款的手續費發票的稅率取決于貨物的名稱，根據“中華人民共和國增值稅政策性文件”，如果是普通商品，發票上的稅率應為17%；如果是教育服務、文化服務、科技服務、社會職能類服務，發票上的稅率應為11%；如果是其它服務和勞務，發票上的稅率應為6%。 此外，發票上除了增值稅外，還包括個人所得稅，普通商品的消費者發票不需要繳納個人所得稅，只需要繳納增值稅；而服務消費者的發票，則不僅需要繳納增值稅，還必須繳納個人所得稅。 拓展知識：物流公司代收貨款的手續費中，可以不繳納增值稅，但是仍需要按照《增值稅普通發票》規定做好相關記錄。