當法人股東變更時，其繳納稅款方式取決于變更后的股東的實際情況。如果變更后的股東是國有股東，則不需要繳納稅款。然而，如果變更后的股東是私人股東，則根據財政部的《中華人民共和國企業所得稅法實施細則》的規定，變更后的私人股東需要繳納變更所得稅。變更所得稅的計算比例為轉讓價格減去變更前股權面值后所產生的利得，再乘以當地政府規定的稅率，以計算出變更所得稅的金額。此外，如果變更后的股東是外國人或者外資機構，則需要繳納營業稅、增值稅和其他稅款。 拓展知識：企業變更法人股東時，除了需要繳納一些稅款外，還需要按照國家規定完成一系列法律手續。這些手續包括： 1、經營者變更登記：需要在工商登記部門提出變更登記申請，并提交相關證明文件，進行經營者變更登記； 2、相關資質取得：由于股東變更，企業可能需要重新申請一些相關資質，例如稅務登記證、社會保險登記證等； 3、財務核算變更：股東變更完成后，變更影響企業的財務核算，包括資產負債表、損益表、現金流量表等，需要對原有的財務數據進行調整； 4、公司章程修改：企業法人股東變更后，需要對公司章程進行修改，以確保章程內容與企業實際情況一致。