一般納稅人開免稅增值稅專用發票的時候，要確認收入的時候應該按照實際收入來確認，即以免稅增值稅專用發票所標明的金額來記賬，而不是根據稅率來計算出來的收入。比如，如果你開一張價稅合計1000元的免稅增值稅專用發票，稅率是6%，那么你在做賬的時候應該按照1000元來確認收入，而不是按照1000/1.06=943.39入賬。 免稅增值稅專用發票具有特殊的稅務效力，但具體而言，要根據發票的內容來確定是按照稅率進行確認收入還是按照發票金額確認收入。更具體地說，如果發票本身上是標明“金額”字樣，那么就按金額來確認收入；如果發票本身上是標明“稅金”字樣，則表明其實確認的是相對于稅率而言的收入。