合伙企業的個人生產經營所得應納稅額的計算公式是：所得稅 = 應納稅所得額 × 稅率－速算扣除數。其中，應納稅所得額為個人生產經營所得減去該項目可享受的減免所得額和免稅額后的金額，稅率根據企業的納稅義務人類別、所得項目以及所處的稅率期不同而有所區別，速算扣除數的金額也有所不同。 合伙企業的個人生產經營所得稅的計算有很多種類，包括非財產性收入、特殊扣除在內的增值稅小規模納稅人的營業收入以及一般納稅人的營業收入。拓展知識：稅收契約原則是指企業與稅務機關就納稅義務規定的簽訂的協議，稅收契約原則賦予企業與稅收機關保持協商、靈活處理、及時調整的權利。