事業單位補發工資的賬務處理需要按照財務規定進行處理，首先，需要按照當月財務賬核對差異分析，確定差額的部分，然后開具工資補發單，發放補發的工資，再經過財務確認，記錄在賬務檔案里。賬務處理還需要根據勞動法律規定，分類合理繳納社會保險費和個人所得稅，以確保財務統一管理。 拓展知識：事業單位補發工資還應當遵守《企業會計準則》的規定，對補發工資的繳納應當根據當前財務報表的準確性進行分類登記，并作好相應賬務處理，確保財務合規管控。